Das Arbeitsgebiet des Netzwerkes ist in vier Kernbereiche eingeteilt, mechanisch/chemische Bearbeitungsverfahren, Ionenstrahl- und Plasmabearbeitungsverfahren, optische Bearbeitungsverfahren und verwandte Gebiete sowie die Charakterisierung von Oberflächen. Speziell in der Optik sind Bearbeitungsverfahren für beliebig geformte Oberflächen, Polierfehlerkorrekturverfahren und Optikbeschichtungstechniken, sowie Geräteentwicklungen für die Lithographie von Strukturen kleiner einhundert Nanometer von hoher industrieller Bedeutung. In diesen Bereichen wird JAT den systematischen Kompetenzausbau fokussieren.